La bonne gouvernance et la transparence dans la gestion des affaires publiques impliquent un contrôle efficace exercé par une institution indépendante et dotée de moyens adéquats.

Au Sénégal, le rôle d'institution supérieure de contrôle des finances publiques est dévolu dès 1960 à un organe du pouvoir judiciaire, la Cour suprême (troisième section).

En 1992, la réforme des institutions judiciaires, dictée par l'impératif de leur spécialisation, transforme la Cour suprême en trois juridictions: le  Conseil Constitutionnel,  la Cour de Cassation et le Conseil d’Etat. C’est à cette dernière et plus particulièrement à sa deuxième section qu'est confiée la fonction de juge des comptes.

La création, en 1999, de la Cour des comptes, Institution supérieure de contrôle des finances publique (ISC) confirme ainsi l’option du législateur de spécialiser les juridictions.